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必读|基因检测的方式方法与途径

 

原创: 李峻岭 医科院肿瘤医院李峻岭医生 5月24日

目前,在很多的疾病治疗领域中,都在提倡精准治疗的理念,在肿瘤治疗的过程中更不例外。自然,作为肿瘤精准治疗的基础,基因检测现今也是关注度极高的话题。

在临床中就有很多病人都在问我:基因检测是什么?为什么要做基因检测?怎么做?类似的问题不胜枚举………….

那么,究竟什么样的病人有必要做基因检测?都有一些什么途径来检查呢?我们今天就来简单了解一下关于基因检测的知识。

什么是基因检测?

首先,我们得要了解什么是基因?基因是遗传的基本单元,携带有遗传信息的DNA或RNA序列,通过复制,把遗传信息传递给下一代,指导蛋白质的合成来表达自己所携带的遗传信息,从而控制生物个体的性状表达。

为什么要做基因检测?

基因与肿瘤到底有什么关系?通常,在肿瘤的基因谱上,有原癌基因和抑癌基因之分。原癌基因是那些在人生长发育、细胞分裂中发挥重要功能的基因。如果原癌基因发生突变,则会导致活性增强,细胞分裂失控,导致肿瘤的产生。目前了解比较深入的原癌基因,比如EGFR和KRAS等。

曾有人形象地将它们比作开车时汽车的油门。抑癌基因是那些抑制细胞增殖的基因,这些基因的存在抑制了细胞的过度增殖,起到限制原癌基因活性的作用。这些基因发生了失活突变,相当于没有了功能,也会导致肿瘤的发生。同样是以开车打比方,其好比是汽车的刹车。

各种不同类型的肿瘤的发生,往往涉及到几个、甚至十几个原癌基因和抑癌基因,机理是非常复杂的,到目前为止,除少数几种基因我们了解比较透彻之外,绝大部分的基因功能我们仍知之甚少。

随著科技的进步,我们正慢慢地揭开某些致癌基因神秘的面纱。我们可以使用新一代的测序技术,更好地、全面、系统地检测更多的基因突变,并根据这些的因突变致病机制来寻找合适的针对性的靶向药物。对于适用的人群而言,使用靶向药物比化疗效果更好,副作用更小,可能获得更理想的疗效。

在肿瘤患者中,若基因检测结果中有相应敏感的基因突变,不同基因突变,适合用不同靶向药物。这就像一把钥匙(靶向药物)对应一把锁(基因突变),要首先知道是什么锁,才能选择合适的钥匙。而通过基因检测的方法,我们可以进一步明确突变类型,选用相应的靶向药,制定出个体化、最优化的治疗方案。

基因检测的方式和途径?

基因检测是通过被检测者外周静脉血或其他组织细胞等,利用生物基因技术,通过特定设备及分子生物技术检测方法、扩增受检者基因信息后,对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测,分析它所含有的基因类型和基因缺陷及其表达功能是否正常的一种方法。肿瘤患者的基因检测的样本可以是多样的,可以是活检后取得的病变组织样本,也可以是血液、其他体液如胸腔、腹腔、心包腔积液、甚至是脑脊液等。常用方法包括组织/细胞活检及液体活检两种。

基因检测方法

基因检测都查什么?

一般来说,亚洲人群EGFR和ALK突变比例达到50%以上,这两个基因突变占了非小细胞肺癌基因突变的一半以上。对于非小细胞肺癌患者,EGFR突变是临床中最常见的突变,通常最需要检测的两个基因就是EGFR和ALK,而且这两类敏感突变患者,可从靶向治疗中显著获益,而且临床上也有效果很好的靶向药物可用。但其他的一些少见基因突变,比如ROS-1,C-MET, VEGF等等,在临床中也有很好的治疗指导价值。

如果单从理论上讲,基因检测越全面,检查的基因谱越多,能给临床医生提供更多的诊断和治疗的信息就越多。但目前来讲,基因检测价格比较昂贵,且大部分需要患者自费负担,所以,基因检测要从实用性、经济性等多方面全面考虑,慎重选择。

哪些患者有必要进行基因检测

一般来说小细胞肺癌的突变类型很不同,目前极少适用靶向药物,所以基因检测的意义不大。而非小细胞肺癌(腺癌、鳞癌、大细胞神经内分泌癌)的I期、II期、III期一般建议进行常见基因检测,例如EGFR及ALK 等,以备将来万一肿瘤复发时指导治疗。当然,对于中晚期且有明显分子靶点的患者,可以根据患者自身情况及经济情况等选择靶向药物进行治疗。

那么在肺癌患者中哪些类型可以做基因检测呢?又有哪些有更适合做基因检测呢?

1.在目前的各个指南中,ASCO则推荐所有患者均可以进行检测,其中肺腺癌与大细胞肺癌做基因检测没有争议。

2.通常鳞癌患者虽然驱动基因突变的概率较低,但也建议进行检测。ESMO则推荐肺鳞癌患者检测,NCCN也认为肺鳞癌可以考虑做,尤其是不吸烟的肺鳞癌患者或者混合类型的肺鳞癌患者。

基因检测的机构和流程

可以做基因检测的机构有很多,但一定要选择正规的、有相关资质认证的机构和医院,建议选择排名靠前的公司检查,而且选择前要与医生沟通,选择检查什么合适的项目。至于是选择组织、还是细胞活检、液体活检,就要根据患者自身的病情以及经济情况决定了。

一般基因检测结果回报的时间均在7-10个工作日之间,根据检查机构的不同回报会有差别。检查结果会提示基因突变的点位、具体的意义以及靶向药物的选择,具体药物选择就由临床医生根据检查结果及患者实际情况做出选择。

基因检测一次就够了吗?

肿瘤存在异质性,在癌症治疗过程中,肿瘤极可能出现耐药或者复发。这时的肿瘤很可能已经和最初的肿瘤不一样,还有可能出现了新的突变,而之前的治疗方案可能不再适用。因此,获取新的肿瘤组织/血液标本,来了解“新肿瘤”特性,对新的用药方案具有重要的指导意义。多次活检、反复的基因检测就有相当的合理性。比如:EGFR突变患者使用第一代靶向药物通常1年左右会发生耐药,其中有50%-60%是由于EGFR基因出现了新的T790M突变引起的,这些患者适合用第三代的靶向药物,而如果没有这种突变,则选择别的治疗方式会更理想。

参考文献:

1.Adjuvant Erlotinib Versus Versus in Patients With

StageIB-IIIANon-Small-CellLungCancer(RADIANT):ARandomized,Double-Blind,PhaseIIITrial.JClin Oncol.

2.Gefitinib Versus Placebo in Completely Resected Non- Small-Cell Lung Cancer: Results of the NCIC CTG BR19 Study.J Clin Oncol.

3.PlattA,MortenJ,JiQ,ElcinP,etal.A retrospective analysis of RET translocation,gene copy number gain and expression in NSCLC patients treated with vandeatanib in four randominzed Phase III studies[J].BMC Cancer.

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